Harry Cohen Tanugi

La conservation des échantillons de selles peut être bénéfique pour la transplantation fécale plus tard dans la vie

Qu'est-ce que l'asthme, les allergies, les maladies du système digestif et le diabète de type 2 ont-ils en commun ? Ils sont beaucoup plus courants aujourd'hui qu'ils ne l'étaient dans le passé. Pourquoi ? Selon les chercheurs, un facteur joue un rôle important dans l'augmentation des taux de maladie : notre mode de vie moderne. Des changements dans notre alimentation et comment nous passons notre temps ont provoqué des changements dans les écosystèmes complexes de microbes qui vivent dans nos intestins.

Le microbiome humain est incroyablement complexe. Sa relation avec la santé et le bien-être est également très controversée et (jusqu'à présent) mal comprise. Cette semaine, une équipe de chercheurs de Harvard Medical School et du Brigham and Women's Hospital s'immisce dans la controverse en publiant une étude sur les effets de l'alimentation sur la santé. un article qui s'oppose à l'idée de "ré-ensauvager" les microbiomes des patients en utilisant les fèces de personnes traditionnelles ou indigènes qui n'ont pas vivent pas le genre de vie industrialisée associée à des taux plus élevés de certaines maladies chroniques.

Au lieu de cela, ils plaident pour l'utilisation des propres excréments du patient (collectés lorsqu'il est jeune et en bonne santé) pour "rajeunir" leur microbiome plus tard dans la vie.. IE s'est assis avec deux des co-auteurs - un généticien et un génomiciste. Scott T. Weiss physicien et chercheur en microbiologie Yang-Yu Liu - pour parler des transplantations fécales et de la façon dont elles pourraient favoriser le bien-être et la longévité.

Cette interview a été modifiée pour des raisons de longueur et de clarté.

Ingénierie intéressante : Pourquoi nos microbiomes doivent-ils être réparés ?

Scott T. Weiss: Le régime alimentaire actuel est beaucoup plus poussé dans le sens des aliments transformés et raffinés, par rapport au régime alimentaire d'il y a même 100 ans. Il y a plus d'aliments transformés, et cela a une influence à la fois sur la biochimie humaine et sur la composition du microbiome intestinal. Je dirais donc qu'à un niveau macroscopique, le régime alimentaire est beaucoup plus raffiné et transformé qu'il ne l'était dans le passé, et même il y a 100 ans.

IE : Poussons un peu plus loin sur ce point. Pourquoi les aliments transformés ont-ils un effet particulier sur la biochimie du corps ?

Weiss : Presque tout ce que vous mangez va avoir une sorte d'effet biochimique. Et en général, il y a moins de fruits, moins de légumes, plus de sucre et plus de graisses saturées dans l'alimentation industrialisée moderne, et cela pousse le microbiome et la biochimie dans un état plus pro-inflammatoire plutôt qu'un état anti-inflammatoire.

Je pense que votre question est bonne car une partie du défi de la recherche sur le microbiome est de définir exactement les voies biochimiques qui sont affectées. Par exemple, nous savons que la consommation de viande a un effet biochimique spécifique qui augmente le risque de maladie coronarienne et un effet biochimique spécifique qui augmente le risque de cancer du côlon. La biochimie de ces voies est assez bien définie. Mais d'un point de vue global, comment ces changements alimentaires macroscopiques influencent-ils le microbiome ? Nous avons encore beaucoup de travail à faire dans ce domaine.

IE : Dans l'article, vous critiquez l'idée de "ré-ensauvager" le microbiome. Pourquoi pensez-vous que c'est une mauvaise idée, et quelle est l'alternative ?

Yang-Yu Liu: Nous avons écrit cet article parce que Scott nous a signalé une New York Times a publié un article sur le microbiome en voie de réapparition, et nous pensons que c'est une idée folle.

L'idée de base est que vous essayez de restaurer votre microbiome intestinal à l'aide d'échantillons que vous prélevez de [people living in a] de la société préindustrielle, comme le Hadza en Afrique. Nous pensons qu'il y a tellement de préoccupations, pas seulement des préoccupations scientifiques mais aussi des préoccupations éthiques.

La principale préoccupation scientifique est que notre société moderne, notre mode de vie et nos habitudes alimentaires ne sont pas comparables à ceux de nos ancêtres, n'est-ce pas ? Donc, si vous faites ce genre de ré-ensauvagement, cela créerait une sorte d'énorme problème de compatibilité entre le donneur et le receveur, d'accord. Le donneur vient d'un environnement très différent, d'une société différente.

Nous voulons simplement proposer une solution alternative : rajeunir notre microbiome en utilisant des échantillons collectés lorsque nous étions jeunes et en bonne santé.

Weiss: L'autre aspect est que le réensauvagement a peu de chances de fonctionner parce qu'il faudrait rester sur le régime alimentaire de ces peuples anciens. La probabilité que vous puissiez maintenir une population moderne sur ce type de régime serait probablement faible, voire nulle.

IE : Vous qualifiez la solution alternative de "rajeunissante". Qu'est-ce que cela signifie, et à quoi cela pourrait ressembler pour une personne tout au long de sa vie ?

Liu : L'idée est très simple. Nous voulons recueillir des échantillons de selles de l'hôte à un plus jeune âge - lorsqu'il est en bonne santé - et les stocker dans une banque de selles pour l'usage futur de l'hôte. Conceptuellement, c'est très similaire à la banque de sang de cordon.

Weiss : Le timing est critique. Vous voudriez recueillir cet échantillon de selles et le mettre en banque lorsque la personne est jeune et en bonne santé. Encore une fois, nous faisons l'analogie avec la banque de sang de cordon. Vous mettez en banque ce [umbilical] échantillon de sang de cordon, et ensuite, si le bébé présente un risque de leucémie ou autre plus tard, on peut faire appel à cet échantillon et l'utiliser pour une transplantation ou autre.

Votre microbiome change au fur et à mesure que vous vieillissez. Et si vous êtes atteint d'une maladie, alors le microbiome va prendre les caractéristiques inflammatoires de cette maladie. Il est donc logique que vous souhaitiez que cette collecte ait lieu lorsque vous êtes en bonne santé, et non lorsque vous souffrez déjà d'une maladie chronique.

IE : De quel âge parlez-vous ici ? On peut supposer que les personnes nées aujourd'hui consomment ce régime industrialisé dès qu'elles mangent des aliments solides, si ce n'est plus tôt.

Weiss : Je pense que pour la plupart des gens, il sera optimal de faire cette collecte entre 10 et 30 ou 40 ans. Nous ne savons pas exactement, et nous devons l'admettre. La fenêtre à laquelle nous avons pensé est celle des adolescents et des jeunes adultes.

Liu : De nombreuses études montrent que pour les enfants d'environ trois ans, leur microbiome intestinal est assez mature. Il est aussi mature que celui de leur mère. Nous ne disons pas que les enfants de trois ans doivent conserver leur échantillon, je veux juste vous donner un point de référence. Vous ne pouvez pas échantillonner les nourrissons parce que leur microbiome intestinal est encore en développement.

IE : Je suis toujours bloqué sur cette idée de régime alimentaire à cause de ce que vous avez dit précédemment sur le fait que le réensauvagement a peu de chances de fonctionner parce que les receveurs n'auraient pas le même régime alimentaire que les donneurs. Ainsi, tout bénéfice disparaîtrait très rapidement. Ne se passerait-il pas la même chose si on rajeunissait le microbiome d'une personne avec ses propres excréments ? Pourquoi ne pas s'attendre à ce que les microbes redeviennent très rapidement ce qu'ils étaient ?

Liu: C'est un très bon point. Dans l'article, nous soulignons que le fait d'avoir ce type de FMT autologue [that's the technical term for rejuvenating the microbiome with a person's own fecal sample] n'est pas suffisant. Il faut garder une alimentation et un mode de vie sains.

IE : Donc, c'est une chance pour une réinitialisation ?

Liu : Oui, d'une manière synergique. Vous ne pouvez pas compter sur cette chose unique. Vous devez manger des aliments sains, faire de l'exercice et avoir un mode de vie sain.

Weiss : Il est prouvé que le microbiome d'une personne souffrant d'obésité massive, par exemple, est clairement différent. [from someone who is not obese]. Ce que Yang veut dire, et qui me semble essentiel, c'est que le TMF autologue ne suffira pas en soi. Vous allez devoir combiner le TMF autologue avec toute une panoplie d'adoptions de style de vie qui vont maintenir la santé : exercice régulier, réduction du stress, régime alimentaire sain, pas de tabagisme et limitation des médicaments que vous prenez. Toutes ces choses peuvent influencer votre microbiome de manière négative.

Je pense que ce serait une erreur de dire que le TMF autologue va tout guérir. C'est ridicule. Ce n'est pas réaliste. Nous pensons que si vous suivez un régime alimentaire sain - et que vous évitez le tabagisme, l'obésité, et ces autres choses - le TMF autologue pourrait vous donner un petit coup de pouce en termes de santé. Cela pourrait être suffisant pour empêcher des personnes qui étaient sur le point de contracter une maladie de la contracter.

IE : Enfin, en termes de sécurité, vous faites remarquer que les selles d'un jeune peuvent contenir des microbes qui sont inoffensifs lorsqu'il est jeune et en bonne santé, mais qui peuvent poser un problème lorsqu'il est plus âgé et reçoit le don. Pouvez-vous nous parler de ce défi ?

Liu : Un de nos collègues a soulevé cette question lorsque nous lui avons envoyé le document pour obtenir son avis : Comment pouvez-vous vous assurer de la sécurité ? Pour répondre à cette préoccupation très légitime, nous suggérons de réaliser des études précliniques en utilisant un modèle de souris pour effectuer ce type de test de sécurité, afin de s'assurer que la matière fécale est suffisamment sûre et ne génère pas de phénotype indésirable comme l'obésité. Je pense que c'est le mieux que nous puissions faire pour le moment. Sinon, comment s'assurer que l'on transplante non seulement le microbiome mais aussi un phénotype indésirable, comme l'obésité ?

Weiss : Il est important de préciser que, même si nous pensons que c'est une idée très intéressante, nous n'avons pas de preuve concluante aujourd'hui que cela fonctionne. Nous ne disons pas dans l'article que nous savons que cela fonctionnerait, mais nous pensons que cela mérite d'être étudié. Il est tout à fait possible que ce soit un complément à un vieillissement sain s'il est utilisé en combinaison avec un tas d'autres activités.

Je ne pense pas que le TMF autologue, en soi, va vous faire vivre 40 % plus longtemps. La question est la suivante : si vous combinez le TMF autologue avec une restriction calorique, la normalisation de votre poids, l'exercice et la réduction du stress, cela peut-il amener quelqu'un à vivre jusqu'à 95 ans au lieu de 80 ans ? Jusqu'à 95 ans en bonne santé ? Nous voulons étudier cela. Nous ne voulons pas simplement dire "allez faire ça", mais nous pensons qu'il y a un potentiel ici.



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