Harry Cohen Tanugi

Des chercheurs viennent de construire un microbiome intestinal humain synthétique. Ils peuvent maintenant le tester comme jamais auparavant

Cependant, la nature collective du microbiome rend difficile l'étude du rôle des organismes et des molécules individuels dans certaines maladies. Notre compréhension des composants individuels du microbiome est si limitée que même les interventions médicales impliquent le transfert complet de matières fécales d'un organisme à un autre. Michael Fischbach, chercheur à Stanford, et son équipe ont donc entrepris de développer leur propre microbiome synthétique afin de mieux comprendre ses composants.

Assemblage du microbiome synthétique

Pour construire leur propre microbiome synthétique, les chercheurs ont cultivé individuellement les organismes constitutifs de l'intestin humain, puis les ont mélangés. Ce faisant, ils devaient s'assurer que le mélange obtenu était non seulement stable mais aussi équilibré, c'est-à-dire qu'aucune espèce ne dominait les autres.

Les chercheurs devaient également s'assurer que le microbiome était fonctionnel et qu'il remplissait les fonctions d'un microbiome naturel. Cette tâche est plutôt délicate, car les microbiomes de deux individus choisis au hasard sont similaires à moins de 50 %. Les chercheurs se sont donc tournés vers le Human Microbiome Project (HMP), un projet public visant à séquencer les microbiomes intestinaux de 300 adultes.

Ils ont commencé leur travail avec 100 espèces bactériennes qui ont été trouvées chez au moins 20 % des participants au HMP et ont ajouté quelques espèces supplémentaires en fonction de l'étude ultérieure. Les 104 organismes ainsi obtenus ont été cultivés individuellement puis combinés pour constituer la première itération du microbiome, baptisée "human community one" ou hCom1.

[SOURCE]

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